Programme

Le programme détaillé figure ci-contre: programme et ci-dessous

Mercredi 29 mai 2024 (amphi SC10.01, bat. 10)

14h30-16h00 - SESSION 1

• 14h30 - 15h00  

Quand la pandémie de Covid-19 a-t-elle été initiée ?

Florence Débarre

• 15h00 - 15h30 

Evolution of virulence in emerging epidemics: from theory to experimental evolution and back.

Wakinyan Benhamou

• 15h30 - 16h00 

Grains, trade and war, multimodal transmission of Rice yellow mottle, an insect-borne plant virus.

Denis Fargette

16h00-16h30 : Pause 

16h30-18h30 - SESSION 2

16h30-17h30 : KEYNOTE -- Tim Vaughan (ETH, Zurich)

• 17h30 - 18h00 

Link between the birth-death and the Kingman coalescent - Applications to phylogenetic epidemiology.

Josselin Cornuault

• 18h00 - 18h30 

Modelling the velocity of evolving lineages and predicting dispersal patterns.

Stéphane Guindon

19h00-20h30: Cocktail

Jeudi 30 mai 2024 (amphi SC10.01, bât. 10)

9h00-10h00 - SESSION 3

9h00-10h00 : KEYNOTE -- Sébastien Lion (CEFE, Montpellier)

10h00 - 10h30 : Pause 

10h30-12h00 - SESSION 4

• 10h30-11h00 

Outbreak reconstruction with a slowly evolving multi-host pathogen: a comparative study of three existing methods on Mycobacterium bovis outbreaks.

Laetitia Canini

• 11h00-11h30 

Leveraging graphical model techniques to study evolution on phylogenetic networks.

Paul  Bastide

• 11h30-12h00 

The spatial Lambda Fleming-Viot process and its relation to Birth-Death models.

Johannes Wirtz

 12h00 - 14h00 : Pause déjeuner

14h00-15h30 - SESSION 5

• 14h00-14h30 

Transformers for EpiDemiological DYnamics: from genomic data to epidemiological parameters.

Vincent Garot

• 14h30-15h00

Using phylogenetic models to predict the impact of pathogenic mutations on symptom severity.

Amélie Ngo

• 15h00-15h30 

Modelling the HIV epidemic in France using virus genomic data.

Louis Colliot

15h30-16h00 : Pause

• 16h00-18h00 - SESSION 6

• 16h00-17h00 

Discussions autour de la définition et prospectives pour la phylodynamique.

• 17h00

Assemblée PHYLODYN2024

Vendredi 31 mai 2024 (amphi SC12.01, bât. 12)

9h00-10h00 - SESSION 7

9h00-10h00 : 

KEYNOTE --  Jacques Dainat "FAIR & reFAIR, the need for transparent science!"

Jacques Dainat

10h00 - 10h30 : Pause

• 10h30-11h00 

Detecting viral recombinant sequences with phylo-k-mers.

Fabio Pardi

• 11h00-11h30 

Evolution of phenotypic noise: an initial, verbal approach.

Ignacio Bravo

• 11h30-12h30 

Table ronde autour de la communication scientifique en temps de crise (animée par Florence Débarre, Mircea Sofonéa et Samuel Alizon)